El Didymo, o moco de roca, es una microalga originaria de Norteamérica que llegó a Chile para convertirse en una plaga. Hoy en día está afectando nuestros ríos desde el Bio Bio hasta Tierra del Fuego. Instituciones como Sernapesca y Amigos de Panguipulli han instalado estaciones de desinfección en la región De Los Rios para evitar la contaminación de nuevos cursos de agua. Esta especie ha sido clasificada como Especie Exótica Invasora (EEI) por el Ministerio del Medio Ambiente.

La quitridiomicosis es una enfermedad provocada por un hongo de origen Africano que ataca a los anfibios (ranas y sapos). Se cree que esta enfermedad sería uno de los responsables de la desaparición de anfibios en el mundo.